273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2182 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  64.88 
 
 
301 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  49.49 
 
 
321 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  49.83 
 
 
303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  49.32 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  45.54 
 
 
307 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  45.89 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  43.52 
 
 
303 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  42.32 
 
 
302 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  41.72 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  42.51 
 
 
307 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 
327 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  41.86 
 
 
302 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  38.93 
 
 
308 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  37.5 
 
 
299 aa  188  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  40 
 
 
294 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  42.07 
 
 
305 aa  188  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  38.78 
 
 
308 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  36.49 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  36.15 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  39.65 
 
 
301 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  36.91 
 
 
299 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  35.81 
 
 
308 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  35.81 
 
 
308 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  35.81 
 
 
308 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  36.7 
 
 
318 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  33.91 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  33.91 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  33.91 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  36.3 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  37.25 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  36.69 
 
 
300 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  38.98 
 
 
306 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  34.92 
 
 
280 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  34.24 
 
 
280 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  33.88 
 
 
314 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  37.07 
 
 
290 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.01 
 
 
318 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  32.43 
 
 
323 aa  128  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  32.77 
 
 
319 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  33.78 
 
 
323 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  30.27 
 
 
293 aa  116  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  28.17 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  30.45 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  29.3 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
269 aa  89  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.58 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  30.99 
 
 
328 aa  85.9  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.59 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.64 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  31 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  28.46 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  28.46 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.46 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  27.64 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.13 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  27.2 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  26.38 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  26.55 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  25.94 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  29.52 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51907  predicted protein  27.91 
 
 
443 aa  68.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.29 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  29.29 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  27.6 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  30.12 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  27.96 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  30.12 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  30.12 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  26.56 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  25.95 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  28.65 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  27.4 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  24.71 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.71 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03184  aldose 1-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13240)  27.74 
 
 
447 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.907432  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  28.48 
 
 
384 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  29.57 
 
 
353 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 
357 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  29.22 
 
 
382 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  29.95 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  28.96 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  28.96 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.81 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  29.22 
 
 
414 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
346 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
346 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
346 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  27.17 
 
 
346 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>