279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8681 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
303 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  65.77 
 
 
302 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  66.01 
 
 
303 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  46.05 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  47.7 
 
 
307 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  46.05 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  42.33 
 
 
315 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  43.85 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  43.54 
 
 
294 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  42.09 
 
 
318 aa  215  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  43.67 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  40.14 
 
 
301 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  40.4 
 
 
321 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  41.72 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  41.47 
 
 
297 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  39.73 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  37.16 
 
 
300 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  38.33 
 
 
311 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  36 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  38.31 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  37.97 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  37.5 
 
 
299 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  36.82 
 
 
300 aa  188  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  38 
 
 
308 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  40.67 
 
 
303 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  39 
 
 
319 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  36.15 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  36.15 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  36.15 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  40.27 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  40.4 
 
 
302 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  35.81 
 
 
295 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  35.81 
 
 
295 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  35.81 
 
 
295 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  39.73 
 
 
290 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  36.82 
 
 
293 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
323 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 
300 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  35.02 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  33.66 
 
 
314 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29.81 
 
 
318 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  33.55 
 
 
325 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  33.07 
 
 
328 aa  99  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  29.02 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.59 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.8 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.68 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 
316 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.67 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  27.21 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  27.27 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  28.23 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  28.23 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  25 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  29.28 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  27.03 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  28.07 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  25.96 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  25.34 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  32.7 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  30.39 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  26.24 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  26.78 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.72 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  27.27 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  27.76 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  26.77 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.41 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  30.96 
 
 
388 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  26.67 
 
 
384 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  27.84 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  24.82 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  30.1 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  26.16 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  25.68 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  27.4 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  30.56 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  26.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  26.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  26.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  26.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  26.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  27.1 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  23.79 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  27.1 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  27.1 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  27.1 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  26.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  27.1 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  27.1 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  29.45 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  27.43 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  28.28 
 
 
387 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>