242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1458 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  49.02 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  46.04 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  30.69 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  28.67 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  30.41 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  31.14 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  29.43 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  28.28 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 311 aa  92  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  29.68 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  29.33 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  29.33 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  28.93 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  28.62 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 325 aa  89.4  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  27.36 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  28.57 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  25.47 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  31.32 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  29.11 
 
 		 297 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  29.11 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  28.03 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  27.64 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.67 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  28.33 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  26.53 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  25.87 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  25.87 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  25.87 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  25.87 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  25.87 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  25.87 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  26.22 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  25.87 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  26.3 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  27.21 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  28.14 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  28.87 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  28.42 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  28.42 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  28.42 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  27.05 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  26.55 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  24.9 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  26.87 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  26.35 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  24.71 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  27.54 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.76 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  28.24 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  27.67 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  25.37 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.29 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  27.49 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  35.9 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  31.03 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  25.99 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  25 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  25.26 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  34.51 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  24.73 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  23.36 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  26.38 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  24.58 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  25.64 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  25.81 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  25.77 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  25.61 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  22.1 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  29.61 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  28.97 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  27.84 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  30.3 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  26.64 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  24.49 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  26.95 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  23.84 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  26.91 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  20.83 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  24.6 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  28.99 
 
 		 359 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  25.93 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>