207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1187 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 354 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  56.45 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  52.38 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  51.84 
 
 		 384 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  51.82 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  50.57 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  52.87 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  52.08 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  49 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  49.57 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  47.99 
 
 		 382 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  48.28 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  51.71 
 
 		 321 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  47.13 
 
 		 382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  48.3 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  45.43 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  47.83 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  49.28 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  47.09 
 
 		 355 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 346 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  46.99 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  46.82 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  52.06 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  48.27 
 
 		 346 aa  315  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  44.51 
 
 		 392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  47.4 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.7 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  44.41 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  45.66 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  47.4 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  43.87 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  43.87 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  46.35 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  46.97 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  46.97 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  45.58 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  43.3 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  45.1 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  45.66 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  43.5 
 
 		 360 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  43.8 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  43.8 
 
 		 390 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  44.92 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  43.52 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  42.59 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 356 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  41.43 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  42.82 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  42.68 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  38.95 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  42.2 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  41.95 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  39.08 
 
 		 406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  41.08 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  41.08 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  40.75 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  40.71 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.66 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  39.67 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 341 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.65 
 
 		 357 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  38.04 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  41.6 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  41.33 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  40.35 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  40.35 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.97 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  41.21 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  38.17 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.42 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  38.64 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  40.24 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>