201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1182 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  100 
 
 
356 aa  725    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  53.67 
 
 
356 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  53.67 
 
 
356 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  50.85 
 
 
383 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  50.28 
 
 
397 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  51.41 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  51.12 
 
 
397 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 
347 aa  345  5e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  47.75 
 
 
393 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  47.31 
 
 
392 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  48.31 
 
 
384 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  48.13 
 
 
355 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  47.18 
 
 
382 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  46.74 
 
 
382 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.03 
 
 
382 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  46.76 
 
 
380 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  46.52 
 
 
390 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  47.32 
 
 
357 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  46.33 
 
 
384 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  45.38 
 
 
388 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  50.94 
 
 
321 aa  310  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  44.94 
 
 
361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  45.45 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  43.97 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  46.2 
 
 
375 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.49 
 
 
355 aa  306  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  43.7 
 
 
414 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  44.79 
 
 
353 aa  298  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 
392 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  46.51 
 
 
350 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 
387 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  42.74 
 
 
387 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  42.74 
 
 
387 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  42.86 
 
 
346 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 
354 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  42.45 
 
 
387 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  41.16 
 
 
357 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 
390 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 
390 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42.57 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  44.66 
 
 
406 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  41.76 
 
 
346 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  40.51 
 
 
346 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  41.69 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  41.88 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 
359 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  42.49 
 
 
359 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 
346 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 
438 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.15 
 
 
355 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 
362 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  44.86 
 
 
317 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  39 
 
 
372 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  39.32 
 
 
385 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.52 
 
 
341 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  40.87 
 
 
357 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  41.35 
 
 
356 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  43.11 
 
 
354 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  41.35 
 
 
356 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  39.51 
 
 
372 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.06 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  39.29 
 
 
360 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  37.82 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  39.41 
 
 
346 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  38.82 
 
 
346 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
352 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  39.12 
 
 
346 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  39.65 
 
 
345 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  40.99 
 
 
355 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
346 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 
351 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  38.64 
 
 
356 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 
368 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  39.58 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 
346 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 
348 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  39 
 
 
350 aa  242  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  37.9 
 
 
348 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 
346 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  37.43 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  36.08 
 
 
377 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  35.96 
 
 
355 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.36 
 
 
362 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.93 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  38.14 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 
376 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>