201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1039 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 357 aa  720    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  52.82 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  50.82 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  51.96 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  49.44 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  48.17 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  53.09 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  54.31 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  48.3 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  46.59 
 
 		 392 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  51.87 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  48.41 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  52.87 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50.84 
 
 		 414 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  45.76 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  46.13 
 
 		 375 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  48.88 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  48.88 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  51.14 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  46.31 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  48.86 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 355 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  48.6 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  46.59 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  45.89 
 
 		 382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  53.07 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  52.02 
 
 		 317 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  47.55 
 
 		 385 aa  311  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  50.42 
 
 		 361 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  48.58 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  47.16 
 
 		 387 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  47.49 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  47.49 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  48.3 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  45.58 
 
 		 355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  45.58 
 
 		 357 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  44.13 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  47.12 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.89 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  45.35 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  41.16 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  44.19 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.16 
 
 		 350 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  45.96 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.98 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  43.34 
 
 		 402 aa  282  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  44.85 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  40.96 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  45.1 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  45.53 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  45.76 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  47.88 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  40.22 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  41.23 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  41.11 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.14 
 
 		 354 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  44.48 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  43.95 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  41.57 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.66 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  40.59 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  42.06 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.74 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  38.84 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  42.25 
 
 		 377 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 345 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  40.85 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40.39 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40.39 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  40.39 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  38.44 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  39.06 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  33.89 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  41.31 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  36.08 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  37.9 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  35.35 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.94 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  36.95 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>