181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0577 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
330 aa  669    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.3 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  42.99 
 
 
347 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  42.72 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  43.17 
 
 
350 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  40.53 
 
 
354 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  38.77 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  39.51 
 
 
387 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  40.92 
 
 
380 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  41.79 
 
 
340 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  36.88 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 
397 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.17 
 
 
355 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  38.69 
 
 
397 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 
355 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  36.12 
 
 
354 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  35.35 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
353 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 
361 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  37.8 
 
 
388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  32.82 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  35.91 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  36.94 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  36.76 
 
 
317 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  36.47 
 
 
393 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  33.54 
 
 
346 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  33.95 
 
 
346 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  32.92 
 
 
346 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  35.17 
 
 
387 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  33.64 
 
 
434 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 
384 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 
347 aa  207  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  34.8 
 
 
414 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 
356 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  32.26 
 
 
371 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  32.26 
 
 
361 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  32.65 
 
 
363 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 
356 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 
356 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  35.59 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  36.17 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  31.48 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  34.78 
 
 
345 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  34.98 
 
 
355 aa  199  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  30.4 
 
 
372 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  31.14 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  31.14 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  33.64 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  32.33 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  32.72 
 
 
382 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  31.48 
 
 
376 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  32.21 
 
 
387 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  29.94 
 
 
362 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  31.45 
 
 
360 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  31.45 
 
 
360 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  30.46 
 
 
362 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  33.13 
 
 
400 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  31.94 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  30.32 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 
387 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  33.03 
 
 
382 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  30.03 
 
 
362 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  32.21 
 
 
359 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  32.54 
 
 
356 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  29.64 
 
 
362 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  29.64 
 
 
362 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  31.6 
 
 
390 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  33.92 
 
 
351 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  31.14 
 
 
402 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  30.37 
 
 
387 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  31.29 
 
 
390 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  30.27 
 
 
385 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  30.37 
 
 
387 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  31.32 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  32.42 
 
 
382 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  32.16 
 
 
351 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
351 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  30.95 
 
 
341 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  30.18 
 
 
357 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  35.2 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  35.33 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  33.02 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 
355 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  33.77 
 
 
344 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
351 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
351 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  29.25 
 
 
346 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  36.03 
 
 
343 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  32.32 
 
 
346 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  33.94 
 
 
354 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  32.74 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  31.23 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  31.9 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  33.64 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.31 
 
 
351 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>