212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2798 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 321 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  56.35 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  54.83 
 
 		 387 aa  362  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  58.13 
 
 		 383 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  57.19 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  52.96 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  52.62 
 
 		 375 aa  343  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  56.07 
 
 		 388 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  51.71 
 
 		 354 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  51.88 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  49.69 
 
 		 393 aa  328  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  52.48 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  52.47 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  52.47 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  55.25 
 
 		 361 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  51.08 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  49.69 
 
 		 382 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  53.27 
 
 		 346 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  50.46 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  52.47 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  51.06 
 
 		 414 aa  315  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  51.09 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  53.07 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  50.94 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  50 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  52.01 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  50.94 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  50.31 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  49.07 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  48.11 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  49.38 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  49.38 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  49.38 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  52.2 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  49.08 
 
 		 390 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  52.01 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  48.77 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  49.07 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  46.11 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  44.1 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  50 
 
 		 359 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  46.79 
 
 		 384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  47.8 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  45.34 
 
 		 359 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  46.13 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  47.83 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  42.19 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  47.5 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  43.37 
 
 		 406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  47.35 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  46.46 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  42.01 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  42.81 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  42.48 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  45.34 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 361 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 371 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  44.38 
 
 		 362 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  43.12 
 
 		 350 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  44.16 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44.75 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.79 
 
 		 400 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  45.57 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  44.06 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.81 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  39.75 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  36.88 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  42.5 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  40.79 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  45.45 
 
 		 319 aa  229  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  44.37 
 
 		 354 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  40.87 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  36.56 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  38.2 
 
 		 351 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  35.94 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  43.69 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  42.68 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  40.5 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  44.05 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  39.01 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>