198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00230 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 340 aa  705    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  42.27 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  41.35 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  40.64 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.47 
 
 		 347 aa  245  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 		 397 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  38.22 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  38.4 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  37.6 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  39.64 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  39.64 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  38.95 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 400 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.75 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  36.08 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 397 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  36.86 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  35.12 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  37.69 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  37.04 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  36.29 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  37.14 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  37.69 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  34.6 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  34.9 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  38.56 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  37.03 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 375 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.47 
 
 		 362 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  34.82 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  35.09 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  36.96 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  34.57 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  33.71 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  34.22 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  34.59 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  33.83 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  33.71 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  33.9 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  34.71 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  34.6 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  34.26 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 368 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  32.28 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  32.1 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  33.61 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  31.86 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  32.36 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  32.44 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  32.76 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  35.13 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  32.94 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  32.34 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  31.98 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  32.07 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  33.04 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>