188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1431 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
354 aa  730    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  49.72 
 
 
380 aa  346  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  47.19 
 
 
384 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  46.59 
 
 
383 aa  341  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  48.44 
 
 
387 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  48.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  47.29 
 
 
382 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  45.74 
 
 
355 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  47.43 
 
 
393 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  47.34 
 
 
375 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  48.02 
 
 
397 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  44.73 
 
 
353 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  44.97 
 
 
382 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  44.41 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  45.45 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  46.59 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  46.9 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  45.22 
 
 
388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  44.35 
 
 
357 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  45.66 
 
 
354 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  44.38 
 
 
356 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  44.38 
 
 
356 aa  294  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  41.24 
 
 
387 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  41.24 
 
 
390 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  41.24 
 
 
387 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  43.75 
 
 
347 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  41.53 
 
 
390 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  44.1 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  41.81 
 
 
434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 
387 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 
387 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  41.97 
 
 
414 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  41.23 
 
 
360 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  43.06 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  43.79 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  40.41 
 
 
346 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  41.5 
 
 
363 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  41.38 
 
 
384 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
346 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
387 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  43.41 
 
 
348 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  42.33 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  41.76 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  38.75 
 
 
359 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
362 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  38.11 
 
 
346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  41.08 
 
 
362 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  41.33 
 
 
376 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  38.83 
 
 
438 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
359 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  42.73 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 
355 aa  259  6e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  39.5 
 
 
371 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  38.94 
 
 
361 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  38.14 
 
 
357 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  37.82 
 
 
402 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  40.53 
 
 
330 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  39.94 
 
 
362 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 
362 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  39.47 
 
 
357 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 
361 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 
347 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  36.99 
 
 
372 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 
385 aa  248  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  38.11 
 
 
406 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 
355 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  38.16 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  37.29 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  35.33 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  35.69 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  38.1 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  37.29 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 
356 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 
356 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  37.99 
 
 
351 aa  242  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  41.4 
 
 
355 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 
362 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 
362 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 
351 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  36.55 
 
 
346 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  38.26 
 
 
347 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  38.53 
 
 
351 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.25 
 
 
351 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 
348 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  41.09 
 
 
340 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
352 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  34.33 
 
 
413 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 
377 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  39.07 
 
 
354 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 
348 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
346 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
346 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
346 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  40.3 
 
 
343 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 
346 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>