198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0819 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 351 aa  701    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  46.84 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  48.56 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  48.86 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  47.04 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  49.43 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  45.3 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  40.87 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.54 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  45.76 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  46.09 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  47.5 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  41.08 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  44.86 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  45.17 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.6 
 
 		 380 aa  258  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  41.48 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  40.75 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  36.57 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  43.34 
 
 		 414 aa  255  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  43.06 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  39.27 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  40.99 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  43.69 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 393 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  43.61 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  40.57 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  44.74 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  41.67 
 
 		 372 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  39.36 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  35.9 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  40.11 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  40.11 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  41.42 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  37.65 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 355 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.53 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  35.61 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  36.75 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  34.9 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  38.75 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  38.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  43.11 
 
 		 376 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.68 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  36.91 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  36.99 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  42.99 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42.52 
 
 		 362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42.52 
 
 		 362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 352 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.57 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  41.11 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  38.29 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  41.37 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 		 385 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  41.07 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  37.14 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  38.19 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 346 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 346 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 346 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  40.77 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  39.81 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  37.94 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  40.8 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>