201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7038 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  98.45 
 
 		 387 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  85.38 
 
 		 390 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  98.45 
 
 		 387 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  84.87 
 
 		 390 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 387 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  80.88 
 
 		 387 aa  620  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  54.4 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  49.74 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  50.27 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  51.18 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  48.83 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  48.93 
 
 		 387 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  47.81 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  49.42 
 
 		 346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  52.17 
 
 		 388 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  47.34 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  51.13 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  51.13 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  48.84 
 
 		 346 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  47.61 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  48.12 
 
 		 346 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  46.76 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  49.02 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  49.31 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  45.08 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  45.61 
 
 		 438 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  45.69 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  48.6 
 
 		 357 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  43.98 
 
 		 390 aa  318  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  48.58 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  44.35 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  42.78 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  48.43 
 
 		 361 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  45.35 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  45.85 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  43.3 
 
 		 354 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  44.03 
 
 		 355 aa  299  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  49.38 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  42.41 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  45.05 
 
 		 434 aa  295  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  47.08 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  43.66 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  41.24 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  43.34 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  42.45 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  45.63 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  43.72 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  46.22 
 
 		 350 aa  282  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  39.04 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  44 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  38.63 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.18 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  41.48 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 406 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  42.12 
 
 		 345 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.74 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  44 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  41.93 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 362 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  37.24 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  38.73 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  39.46 
 
 		 363 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  39.09 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 340 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  39.82 
 
 		 341 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.99 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.99 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 351 aa  216  8e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  34.4 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  34.49 
 
 		 340 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 344 aa  212  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  32.78 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  35.83 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  34.22 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  41.03 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  37.98 
 
 		 346 aa  210  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  36.44 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  36.44 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  37.78 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  37.1 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>