218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2506 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 355 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  65.44 
 
 		 354 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  51.16 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  50.87 
 
 		 352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  45.11 
 
 		 348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  45.35 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  45.99 
 
 		 347 aa  312  6.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  45.88 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  45.93 
 
 		 346 aa  305  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  45.03 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  45.03 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  45.27 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  45.27 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  44.97 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 346 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  44.15 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  43.52 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  42.52 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  39.19 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  40.99 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  39.47 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  41.4 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  39 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  39.13 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  36.94 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  39.14 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  39.59 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  39.8 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  35.26 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  38 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  37.31 
 
 		 347 aa  218  8.999999999999998e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  36.79 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  37.93 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.13 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  35.19 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  35.45 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 414 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  37.83 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  40.91 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  38.08 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.64 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  33.92 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  36.13 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  36.47 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  34.89 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  38.71 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.55 
 
 		 347 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  37.3 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  37.3 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  33.78 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  41.7 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  35.48 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  35.6 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  34.91 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  34.97 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  38.56 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  32.87 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>