191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2889 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  100 
 
 
356 aa  733    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  73.3 
 
 
350 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  71.26 
 
 
348 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  71.09 
 
 
348 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  68.55 
 
 
347 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  67.36 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  67.36 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  62.43 
 
 
346 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  62.43 
 
 
346 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  62.43 
 
 
346 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  62.43 
 
 
346 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  62.13 
 
 
346 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  62.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  62.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  62.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  62.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  62.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  62.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  61.65 
 
 
346 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  60.53 
 
 
346 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  50.28 
 
 
347 aa  342  7e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  51.03 
 
 
350 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  48.97 
 
 
352 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  48.24 
 
 
357 aa  319  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  44.97 
 
 
355 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  45.4 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00698  hypothetical protein  62.56 
 
 
205 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3331  aldose 1-epimerase  44.14 
 
 
379 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  41.09 
 
 
383 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
346 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.3 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  38.12 
 
 
380 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.36 
 
 
363 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  39.42 
 
 
359 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  41.07 
 
 
343 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  39.23 
 
 
362 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
362 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
362 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  40.38 
 
 
344 aa  215  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  40.38 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  40.38 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  41.51 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  40.38 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  35.47 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  35.17 
 
 
354 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  37.97 
 
 
357 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 
356 aa  212  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 
392 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  39.81 
 
 
343 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  38.64 
 
 
376 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  36.24 
 
 
387 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  40.62 
 
 
343 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  39.31 
 
 
344 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  37.57 
 
 
387 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 
384 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.13 
 
 
360 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.13 
 
 
360 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 
397 aa  208  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.75 
 
 
362 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  38.26 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.89 
 
 
351 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  34.6 
 
 
393 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.13 
 
 
355 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  38.96 
 
 
346 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  38.72 
 
 
375 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  41.64 
 
 
317 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  36.99 
 
 
361 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  31.29 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
434 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  35.57 
 
 
359 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
356 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
356 aa  199  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  37.58 
 
 
346 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
347 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  34.58 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 
371 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 
384 aa  195  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  34.77 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  38.17 
 
 
342 aa  193  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  32.01 
 
 
355 aa  192  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
372 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  33.82 
 
 
382 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  34.49 
 
 
382 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  37.69 
 
 
341 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  37.73 
 
 
321 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  36.49 
 
 
438 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  37.19 
 
 
339 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  36.31 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  36.16 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
351 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  36.92 
 
 
356 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  37.86 
 
 
350 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>