205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0738 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 359 aa  744    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  53.12 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  51.85 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  49.14 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  46.26 
 
 		 397 aa  309  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  46.63 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.79 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  45.1 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  47.11 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  46.82 
 
 		 355 aa  298  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  46.58 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  42.54 
 
 		 382 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.73 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  43.26 
 
 		 357 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 387 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  47.11 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 356 aa  285  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  45.43 
 
 		 402 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  40.87 
 
 		 351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  43.97 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  44.61 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  45.34 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 387 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  43.39 
 
 		 390 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  40.92 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  40.92 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  42.7 
 
 		 384 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  44.41 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  41.45 
 
 		 400 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  41.23 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  39.39 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  40.7 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  41.57 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  40.94 
 
 		 354 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  41.88 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.41 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  41.48 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  41.48 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  39.52 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  42.36 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.17 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  38.05 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.55 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  42.24 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.02 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.15 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  42.44 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  38.11 
 
 		 406 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  40.7 
 
 		 376 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  41.28 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  41.28 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  38.35 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  40.8 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.04 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.04 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  36.95 
 
 		 350 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  38.87 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  38.87 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.85 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  38.04 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  36.05 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>