200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0809 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  99.13 
 
 
346 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  99.13 
 
 
346 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  99.13 
 
 
346 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  99.42 
 
 
346 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  100 
 
 
346 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  87.79 
 
 
346 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  87.79 
 
 
346 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  87.79 
 
 
346 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  87.79 
 
 
346 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  87.79 
 
 
346 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  87.79 
 
 
346 aa  627  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  87.79 
 
 
346 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  77.91 
 
 
346 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  62.43 
 
 
356 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  61.27 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  61 
 
 
350 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  60.35 
 
 
356 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  60.35 
 
 
356 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  60.12 
 
 
348 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  59.37 
 
 
347 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00698  hypothetical protein  85.22 
 
 
205 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  50.44 
 
 
352 aa  352  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  49.85 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  49.12 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  51.03 
 
 
347 aa  334  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 
354 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 
355 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.12 
 
 
383 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  41.94 
 
 
387 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
356 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  38.35 
 
 
397 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
392 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3331  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  38.35 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  39.69 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
354 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  39.3 
 
 
359 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  40.63 
 
 
384 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 
346 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  41.51 
 
 
317 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  35.8 
 
 
392 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  39.49 
 
 
414 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  37.03 
 
 
382 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 
354 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 
359 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
387 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  40.59 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  40.59 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.58 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  36.69 
 
 
393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.89 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 
384 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  38.44 
 
 
346 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  37.86 
 
 
361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  37.09 
 
 
346 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
351 aa  215  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 
362 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  37.83 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  37.77 
 
 
344 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  40.19 
 
 
321 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  37.83 
 
 
361 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 
343 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 
362 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
388 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  36.31 
 
 
372 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  36.06 
 
 
347 aa  209  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 
343 aa  208  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.74 
 
 
344 aa  208  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  38.68 
 
 
343 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  38.3 
 
 
390 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 
376 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  38.36 
 
 
343 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 
371 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  37.74 
 
 
343 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 
390 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  39.71 
 
 
357 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  36.18 
 
 
360 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.39 
 
 
400 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  37.83 
 
 
356 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  34.42 
 
 
355 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
355 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  37.64 
 
 
402 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  35.9 
 
 
438 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  36.16 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 
387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>