193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1611 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 438 aa  885    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  50.55 
 
 		 388 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.55 
 
 		 383 aa  329  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  46.32 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  47.15 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  47.15 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  46.05 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  46.05 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  44.47 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  45.8 
 
 		 387 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  44.86 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  41.63 
 
 		 380 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  44.57 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  44.26 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  45.69 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  43.01 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  45.41 
 
 		 346 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  45.19 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  42.23 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  41.8 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  43.51 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  43.36 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  43.51 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  41.8 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  41.87 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  43.58 
 
 		 346 aa  289  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 392 aa  289  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.01 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 390 aa  285  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 346 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  44.85 
 
 		 357 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  40.51 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  42.59 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  44.38 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  42.31 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  40.97 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  43.13 
 
 		 361 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  40.87 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  40.33 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.83 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.09 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  40.26 
 
 		 372 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.26 
 
 		 353 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  42.48 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  41.01 
 
 		 357 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  39.52 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  39.39 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  41.49 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  39.19 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  41.67 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.37 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  40.05 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  41.16 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.91 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.64 
 
 		 341 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  35.12 
 
 		 340 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  37.7 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  33.42 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  37.6 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  38.06 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  33.26 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  38.52 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  38.52 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  37.92 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  37.66 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  37.77 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  36.68 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  38.96 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  37.63 
 
 		 362 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  37.63 
 
 		 362 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  34.99 
 
 		 355 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  36.15 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  35.04 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  34.89 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  37.6 
 
 		 350 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.68 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.86 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  35.97 
 
 		 339 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  34.16 
 
 		 345 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  35.9 
 
 		 346 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  35.9 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  35.9 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  37.81 
 
 		 356 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>