219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6508 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 362 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 362 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  98.9 
 
 		 362 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  84.53 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  83.38 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  83.15 
 
 		 362 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  80.82 
 
 		 376 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  65.92 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  65.63 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  62.91 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  62.91 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  59.62 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  42.17 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  43.87 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  42.32 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  45.22 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  45.22 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  46.7 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.66 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  44.93 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  44.32 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  40.39 
 
 		 397 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  42.41 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  40.38 
 
 		 382 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 384 aa  248  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  42.45 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  42.14 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  42.5 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  42.14 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 357 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.66 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  36.06 
 
 		 392 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  42.08 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  38.96 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  42.94 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  41.49 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  40.39 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  37.08 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  37.86 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  38.78 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  42 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  42 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 		 387 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  41.07 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  41.28 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.26 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  42.52 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  43.39 
 
 		 356 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  41.11 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  38.87 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  39.48 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.2 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  40.38 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 		 344 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.97 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 356 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>