187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0788 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 357 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  55.06 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  52.38 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  53.61 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  52.84 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  51.7 
 
 		 380 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  52.54 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  50.28 
 
 		 387 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  49.3 
 
 		 393 aa  342  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  50.44 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 375 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  48.04 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  47.32 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  46.07 
 
 		 355 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  47.16 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.77 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  45.04 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  47.77 
 
 		 382 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  47.91 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  49.07 
 
 		 321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  45.58 
 
 		 357 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  45.35 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  44.35 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 392 aa  299  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  46.89 
 
 		 361 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  47.06 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  47.06 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.78 
 
 		 355 aa  296  5e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  43.26 
 
 		 359 aa  292  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  45.09 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.32 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  45.2 
 
 		 346 aa  281  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  44.35 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  44.35 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  42.18 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  43.87 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  44 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  43.26 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  43.59 
 
 		 346 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  40.96 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  40.16 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  46.8 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  41.99 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  42.05 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  41.01 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  41.28 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  39.22 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  38.74 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  40.41 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  39.66 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  39.19 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  40.76 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  39.26 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.72 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.72 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  39.29 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  39.08 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  37.11 
 
 		 347 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  39.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  36.62 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  39.59 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  38.73 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  35.77 
 
 		 361 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  38.82 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  37.79 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  37.79 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.86 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>