222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6030 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  86.46 
 
 		 362 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 362 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  97.23 
 
 		 362 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  83.15 
 
 		 362 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  82.87 
 
 		 362 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  83.15 
 
 		 362 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  80.28 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  65.55 
 
 		 361 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  63.14 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  62.36 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  62.36 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  62.36 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  40.72 
 
 		 380 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  41.88 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  43.3 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  44.15 
 
 		 355 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  40.46 
 
 		 387 aa  268  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  44.93 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  44.06 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  42.66 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  41.23 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  40.41 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  43.8 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  41.26 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  42.6 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  42.6 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  44.09 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  41.6 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 		 392 aa  245  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  42.51 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  42.51 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  36.93 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  42.62 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  38.32 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  42.35 
 
 		 390 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  41.26 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  37.15 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  42.81 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  42.15 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  39.64 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  43.79 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 414 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  37.08 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  41.02 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.2 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  38.17 
 
 		 343 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  40.65 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.53 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 343 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.81 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  38.51 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.24 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  39.11 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  39.11 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  38.81 
 
 		 360 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  37.98 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  41.07 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.01 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  37.69 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>