182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0556 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 353 aa  728    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  44.73 
 
 		 354 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  43.5 
 
 		 383 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  42.21 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  42.94 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  44.79 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  42.32 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  42.25 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  41.74 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  41.36 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  41.79 
 
 		 382 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  43.82 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  43.82 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  39.04 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  39.04 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  40.63 
 
 		 382 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  42.03 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  40.96 
 
 		 357 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  41.43 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  39.26 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  42.19 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 434 aa  271  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  38.4 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  38.4 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  37.88 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.81 
 
 		 388 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  38.26 
 
 		 438 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  41.34 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  43.42 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.22 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 392 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 		 362 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  35.28 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.54 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  35.98 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.93 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  37.1 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  36.44 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  35.84 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.09 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  34.66 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  37.69 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  35.73 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  33.99 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  33.99 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  32.51 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 377 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  37.01 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  37.06 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  39.09 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 354 aa  212  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  34.02 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  37.83 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  31.44 
 
 		 413 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  34.81 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  34.02 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0818  Aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376675  normal  0.120929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>