217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3593 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 355 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  46.76 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  43.17 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  43.37 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  43.37 
 
 		 382 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  44.21 
 
 		 388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 387 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  44.65 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  43.15 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  43.11 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  41.9 
 
 		 392 aa  275  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  44.08 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  41.34 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  42.31 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  43.86 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 354 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  42.69 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  43.97 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  43.97 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  41.86 
 
 		 375 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  42.65 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  44.15 
 
 		 362 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  43.18 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  41.13 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  43.18 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  42.74 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  42.27 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  42.43 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  42.27 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  42.68 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  43.18 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.83 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42.66 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  39.17 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  41.72 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  41.83 
 
 		 359 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  44.28 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  42.77 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  43.4 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  40.35 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  43.11 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  41.64 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  41.98 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 321 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  40.58 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  40.75 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  40.11 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  39.23 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.07 
 
 		 360 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.07 
 
 		 360 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  40.76 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  41 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  37.37 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  37.67 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 351 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  39.26 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  38.12 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  42.03 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  37.64 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  35.84 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  37.98 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  39.36 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  38.12 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  37.17 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  38.6 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  38 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.01 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  38.26 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  38.39 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  39.41 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  40.32 
 
 		 413 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>