197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2311 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 355 aa  718    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  78.45 
 
 		 350 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  56.77 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  55.13 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  53.1 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  53.49 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  52.1 
 
 		 375 aa  358  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  50.57 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  51.47 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  52.22 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  48.86 
 
 		 434 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  48.83 
 
 		 382 aa  342  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 382 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  48.13 
 
 		 356 aa  332  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  45.74 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  50.99 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  46.45 
 
 		 392 aa  325  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  47.09 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  52.48 
 
 		 321 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  52.27 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  48.14 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  50.88 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50.55 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  48.39 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  49.72 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  47.58 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  46.07 
 
 		 357 aa  311  9e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  47.23 
 
 		 385 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  46.99 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  48.39 
 
 		 387 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  46.44 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  44.76 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  47.46 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  46.33 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  47.46 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  45.58 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  44.64 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  47.66 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  47.37 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  47.37 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  46.82 
 
 		 359 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  47.37 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  50.15 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  47.08 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 406 aa  292  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  42.57 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  45.2 
 
 		 402 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  49.15 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  45.33 
 
 		 355 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  44.17 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.34 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  46.86 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  45.33 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  46.7 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  46.7 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  40.45 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44.57 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  44.83 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  43.73 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  43.73 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  42.27 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  40.21 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  44.67 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  44.09 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  39.47 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  44.54 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.36 
 
 		 348 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  37.33 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  40.59 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  40.74 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  42.2 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  41.06 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  34.73 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  41.32 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.16 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  38.9 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  38.11 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>