190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4369 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 372 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  51.64 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  45.43 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50.13 
 
 		 414 aa  318  9e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  44.89 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  50.56 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  47.93 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  48.49 
 
 		 357 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  48.08 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  48.91 
 
 		 361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  47.66 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  45.82 
 
 		 346 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  45.86 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  45.72 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  46.01 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  44.78 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  45.65 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  44.26 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  44.26 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  45.01 
 
 		 346 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  44.81 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  43.94 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  41.87 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  43.84 
 
 		 380 aa  292  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  43.29 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  43.72 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  48.39 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  41.46 
 
 		 393 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  43.72 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.51 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  43.29 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  38.96 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  43.6 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  43.6 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  46.01 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  45.08 
 
 		 355 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44.93 
 
 		 357 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  42.03 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  42.47 
 
 		 385 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  40.05 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.6 
 
 		 347 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  46.47 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  40.26 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.51 
 
 		 356 aa  262  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42.35 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  45.07 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  42.22 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 359 aa  252  9.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  42.05 
 
 		 350 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  43.17 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.26 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  39.29 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.48 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  41.8 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42.08 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42.08 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  41.8 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  35.97 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.43 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  41.53 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  41.8 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.64 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  39.41 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.34 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  38.87 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  32.79 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  33.51 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.23 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.23 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  32.98 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  38.4 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.38 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  35.65 
 
 		 340 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  34.44 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  37.47 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 343 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  32.47 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  33.78 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  34.89 
 
 		 346 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  34.89 
 
 		 346 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>