226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002663 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 354 aa  739    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  65.44 
 
 		 355 aa  502  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  52.01 
 
 		 357 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  51.86 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  49.28 
 
 		 350 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  49.4 
 
 		 356 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  49.4 
 
 		 356 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  47.08 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  48.41 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  48.41 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  48.41 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  48.41 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  48.41 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  48.41 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  46.73 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  47.83 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  46.73 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 		 346 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  46.67 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  46.38 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  45.09 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  42.6 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  45.4 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.03 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  44.73 
 
 		 380 aa  275  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  42.46 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  43.15 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  43.11 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  40.94 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  41.13 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.24 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 390 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  41.35 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  42.94 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  41.52 
 
 		 392 aa  252  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  41.67 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  41.27 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  41.35 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  39.3 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  42.2 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  39.65 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.36 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  40.46 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  39.07 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  37.72 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  44.37 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  37.7 
 
 		 438 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  36.41 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  38.71 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  41.16 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  35.38 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  38.87 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.73 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  36.96 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.89 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  36.5 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  36.59 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  35.47 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  35.6 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  35.98 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  35.6 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  35.53 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>