210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1122 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  100 
 
 
392 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  56.78 
 
 
380 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  48.99 
 
 
397 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  54.64 
 
 
387 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  49.72 
 
 
383 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  50.51 
 
 
390 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  47.85 
 
 
384 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 
375 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  46.95 
 
 
393 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  52.54 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  47.41 
 
 
382 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  49 
 
 
354 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  50.58 
 
 
388 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.12 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  49.72 
 
 
414 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  45.08 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  51.55 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  51.55 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 
382 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  47.3 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  50 
 
 
321 aa  334  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  46.59 
 
 
357 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  47.31 
 
 
356 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  46.45 
 
 
355 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  43.08 
 
 
387 aa  325  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  45.13 
 
 
387 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  45.93 
 
 
346 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  43.05 
 
 
387 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  43.05 
 
 
387 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  44.38 
 
 
390 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  43.27 
 
 
346 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  43.84 
 
 
346 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  43.84 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  48.16 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  42.41 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  45.89 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  44.11 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  43.58 
 
 
384 aa  312  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  43.82 
 
 
387 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  39.34 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  45.45 
 
 
434 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  42.08 
 
 
402 aa  308  9e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  43.27 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  43.59 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  42.21 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  46.49 
 
 
317 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  42.37 
 
 
359 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  41.27 
 
 
438 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  40 
 
 
359 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 
368 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  41.67 
 
 
385 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  41.9 
 
 
355 aa  275  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  38.42 
 
 
372 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 
406 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
360 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.92 
 
 
348 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  41.21 
 
 
357 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 
341 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  40.71 
 
 
347 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  37.64 
 
 
360 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  37.64 
 
 
360 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.72 
 
 
350 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  38.29 
 
 
355 aa  256  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 
362 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  41.52 
 
 
354 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 
363 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  36.22 
 
 
371 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  41.77 
 
 
343 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
362 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.75 
 
 
362 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  38.77 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.06 
 
 
362 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.06 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.06 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  35.83 
 
 
361 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  35.61 
 
 
351 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  40.55 
 
 
340 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  38.07 
 
 
351 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 
350 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  39.22 
 
 
348 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
346 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
346 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  36.07 
 
 
357 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 
346 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
346 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 
346 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  38.86 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>