178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3100 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 377 aa  768    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  43.99 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  42.46 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  39.41 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  41.88 
 
 		 380 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  41.43 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  41.67 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  39.11 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  42.78 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  38 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  40.81 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  43.73 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  36.08 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  42.77 
 
 		 346 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  42.25 
 
 		 357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  43.73 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  34.79 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  39.14 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  40.35 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  37.77 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  35.36 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 353 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  40.96 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  37.6 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.64 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.52 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 375 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  35.23 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  39.49 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.31 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  39.19 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  37.04 
 
 		 350 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  36.89 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  34.69 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  36.57 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  32.4 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  32.49 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  32.01 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  37.36 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  36.54 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  34.58 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  34.48 
 
 		 346 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  35.13 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  34.01 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 371 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  35.44 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  32.1 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 356 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 356 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  31.42 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  31.62 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  34.48 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  37.36 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  33.62 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  34.47 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  36.04 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>