182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3655 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 413 aa  848    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.38 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  34.33 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  38.9 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  38.53 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  40.32 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  36.41 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 351 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  33.52 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  35.75 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 		 361 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  34.32 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  33.51 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 397 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  31.44 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  33.51 
 
 		 382 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.23 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  35.6 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  35.53 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  35.39 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  33.08 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  35.42 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  36.31 
 
 		 375 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 351 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  33.79 
 
 		 360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  35.6 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  35.55 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 360 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 360 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  35.09 
 
 		 362 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  35.09 
 
 		 362 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  36.96 
 
 		 359 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  33.06 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  35.11 
 
 		 387 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  35.11 
 
 		 387 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  34.27 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  34.46 
 
 		 384 aa  190  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  35.25 
 
 		 362 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  34.64 
 
 		 359 aa  189  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  32.05 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  32.05 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.51 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  32.5 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.51 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  34.55 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  34.97 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  35.47 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  34.43 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 		 347 aa  186  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  32.8 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  32.91 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  32.34 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  33.79 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  35.44 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.01 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  33.15 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  36.04 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  35.54 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  36.94 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  33.15 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  31.81 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  31.4 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  36.41 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  32.58 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  33.8 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  31.54 
 
 		 346 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  31.36 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  34.16 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  34.06 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  32.11 
 
 		 357 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  32.4 
 
 		 350 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  32.42 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  31.89 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  30.03 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>