202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1309 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
319 aa  657    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  40.91 
 
 
355 aa  235  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  40.24 
 
 
354 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  39.75 
 
 
317 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  45.45 
 
 
321 aa  229  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  41.89 
 
 
397 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
346 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  40.48 
 
 
346 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.6 
 
 
383 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  42.09 
 
 
388 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  38.07 
 
 
392 aa  215  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  40.83 
 
 
356 aa  215  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  40.83 
 
 
356 aa  215  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 
375 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  40.99 
 
 
387 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  37.87 
 
 
393 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  37.72 
 
 
414 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  38.27 
 
 
390 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.91 
 
 
354 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  38.69 
 
 
346 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.64 
 
 
356 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  40 
 
 
346 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 
384 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 
384 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  37.93 
 
 
397 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  39.02 
 
 
347 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  38.14 
 
 
380 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  36.5 
 
 
346 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 
387 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  41.07 
 
 
361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  38.51 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.35 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 
387 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
387 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
387 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  37.24 
 
 
402 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.14 
 
 
434 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
390 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
387 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  39.81 
 
 
355 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 
357 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 
382 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 
357 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 
385 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  36.99 
 
 
390 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  34.5 
 
 
406 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  39.42 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  38.41 
 
 
336 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  38.81 
 
 
360 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  38.81 
 
 
360 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 
382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 
341 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  36.81 
 
 
339 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  38.37 
 
 
359 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  36.84 
 
 
400 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  36.71 
 
 
361 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.94 
 
 
376 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  37.9 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  32.68 
 
 
438 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.6 
 
 
357 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  33.8 
 
 
413 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  36.04 
 
 
350 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  35.28 
 
 
347 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  35.22 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  37.95 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 
340 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  36.53 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  35.22 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  34.23 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  35.76 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  32.69 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  33.75 
 
 
350 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  34.47 
 
 
346 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  39.52 
 
 
350 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  35.28 
 
 
351 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 
362 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
357 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  36.47 
 
 
362 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 
356 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  34.08 
 
 
351 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  32.42 
 
 
346 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 
356 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  32.11 
 
 
346 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  32.11 
 
 
346 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  32.11 
 
 
346 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  32.11 
 
 
346 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  32.11 
 
 
346 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  32.11 
 
 
346 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 
362 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 
362 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  36.34 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>