186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3572 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  100 
 
 		 327 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  96.94 
 
 		 327 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  78.59 
 
 		 327 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  45.59 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  39.69 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  37.95 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  39.17 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  38.87 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  38.58 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  39.03 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.73 
 
 		 361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  36.23 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  35.34 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  39 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  37.29 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.86 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  36.86 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  34.48 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  34.37 
 
 		 414 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 434 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  33.99 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  39.43 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  34.49 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  34.49 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  32.09 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  35.84 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  33.14 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  33.14 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  33.14 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  35.42 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  33.8 
 
 		 402 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  32.55 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  32.06 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  29.77 
 
 		 393 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  35.26 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  34.21 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  34.21 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  34.5 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  31.18 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  31.47 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.92 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  34.2 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  30.46 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  29.31 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  32.44 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  32.17 
 
 		 368 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  31.16 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  33.69 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  32.3 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  29.79 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  28.61 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  29.74 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  34.6 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  31.91 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  31.91 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>