202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2751 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 336 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  45.99 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  43.67 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  42.47 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  39.82 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  39.23 
 
 		 340 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  40.57 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  40.8 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  39.48 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  40.85 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  40.54 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  37.47 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  39.14 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  39.76 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  35.9 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 397 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  35.57 
 
 		 347 aa  202  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  39.09 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  38.31 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  32 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  36.44 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  35.98 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 372 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  34.01 
 
 		 434 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  34.97 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  35.55 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  36.42 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  34.82 
 
 		 400 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  34.09 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  35.26 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  37.17 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  30.9 
 
 		 392 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 375 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  31.69 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  36.29 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  34.97 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  35.07 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  34.56 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  31.58 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  31.6 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  34.21 
 
 		 348 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  34.97 
 
 		 350 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  29.51 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  33.83 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  30.29 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  28.53 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  34.01 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  34.01 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  33.82 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  34.67 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  30.79 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  31.73 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  31.73 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  30.56 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  32.75 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  28.65 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  32.65 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>