176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2683 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 334 aa  681    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  46.04 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  45.73 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  45.43 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  37.84 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  37.74 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  35.87 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 384 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  34.96 
 
 		 388 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  31.56 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  32.66 
 
 		 400 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  31.18 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  32.56 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  31.34 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  32.95 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  31.94 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  31.41 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  32.33 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  32.46 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  32.85 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  33.7 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  34.98 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  30.75 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  28.49 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  34.88 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  32.97 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  32.28 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  32.28 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  30.46 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  29.8 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  30.35 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  29.74 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  31.32 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  29.86 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  29.62 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  31.99 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  29.19 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  30.11 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  30.66 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  30.14 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  29.82 
 
 		 393 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  29.34 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  29.63 
 
 		 397 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0030  aldose 1-epimerase  29.27 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  35.07 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  29.8 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  29.73 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1851  Aldose 1-epimerase  29.88 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0818  Aldose 1-epimerase  29.75 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376675  normal  0.120929 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  30.55 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  24.55 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0348  Aldose 1-epimerase  25.68 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0152282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  30.57 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 390 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  29.35 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  30.42 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  28.78 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  31.83 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  30.61 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  28.19 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  25.35 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  28.49 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  28.19 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  31.48 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>