183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0030 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0030  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 335 aa  685    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  41.16 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  34.56 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  34.25 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  33.03 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  32.91 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  32.26 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  35.18 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  33.23 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  31.74 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  28.66 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  32.58 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0348  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0152282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  31.52 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  30.46 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  31.94 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1851  Aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  29.73 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  31.72 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  31.7 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  31.21 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  30.61 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  30.61 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  34.35 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  34.35 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  28.74 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  27.38 
 
 		 380 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  30.84 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  29.94 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  28.65 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  31.33 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  31.49 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0576  aldose 1-epimerase  29.7 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  32.4 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  31.36 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  30.12 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  31.14 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  31.17 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  31.87 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  29.91 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  32.64 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  31.21 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  32.21 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  31.21 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  28.49 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  28.87 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  30.13 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  30.54 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  28.53 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  27.86 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  31.1 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  26.44 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  30.91 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  28.86 
 
 		 438 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  30.38 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  27.35 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  29.85 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  27.98 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  30.53 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  29.74 
 
 		 361 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  31.6 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  27.1 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  29.27 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>