195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1344 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  93.53 
 
 		 340 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 343 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  42.64 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  43.81 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  41.69 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  41.77 
 
 		 392 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  41.59 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  39.69 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  35.86 
 
 		 414 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  37.01 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  35.84 
 
 		 382 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  39.51 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  40.3 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  36.56 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.36 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  35.12 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  35.96 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  36.9 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  35.65 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  39.08 
 
 		 393 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  34.4 
 
 		 387 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  34.4 
 
 		 387 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  37.69 
 
 		 350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  35 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  36.65 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  39.09 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  33.64 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  34.11 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  35.93 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  37.05 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  34.4 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  35.03 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0354  aldose 1-epimerase  35.37 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  36.2 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  32.94 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  32.22 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  33.94 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0321  Aldose 1-epimerase  37.8 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.45 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  32.94 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  36.04 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  36.04 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  32.75 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 406 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  36.12 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  33.83 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  34.74 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  31.88 
 
 		 372 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  30.68 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  32.42 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 341 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  32.28 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  32.83 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  31.42 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  31.55 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  33.53 
 
 		 344 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.37 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>