213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2344 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 363 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  64.58 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  64.49 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  61.9 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  62.64 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  60.38 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  62.36 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  60.38 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  63.04 
 
 		 376 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  59.62 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  59.62 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  59.07 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  44.94 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  45.76 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  49.15 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  44.17 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  41.5 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  43.85 
 
 		 375 aa  275  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  42.05 
 
 		 397 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  47.83 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  42.77 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  40.76 
 
 		 393 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  42.43 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  45.24 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  44.14 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  44.14 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  45.79 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  39.95 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  43.64 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  46.48 
 
 		 350 aa  255  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  40.95 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  41.95 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  39.27 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 414 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  42.36 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  44.28 
 
 		 317 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  43.52 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  39.68 
 
 		 372 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  45.04 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  40.85 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  43.44 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  38.48 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  41.16 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 346 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  36.41 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  40.54 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  40.84 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  40.84 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  37.71 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  39.29 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  40.65 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  42.99 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  39.46 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  39.46 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  39.84 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  37.94 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  37.92 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  41.21 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  40.28 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.58 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.06 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  40.36 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  38.51 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  36.05 
 
 		 343 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  39.05 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>