196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2682 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 406 aa  848    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  40.52 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  42.4 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.03 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  40.67 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  40.59 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  44.66 
 
 		 356 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  42.69 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  41.09 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  42.41 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  40.57 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  41.6 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  40.16 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  40.22 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  43.37 
 
 		 321 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  40.96 
 
 		 350 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  39.17 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  38.96 
 
 		 390 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  39.08 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 387 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  37.16 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  39.06 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  39.31 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.11 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  39.54 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  35.16 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 353 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  39.01 
 
 		 362 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  34.91 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  39.22 
 
 		 346 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  38.73 
 
 		 346 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  37.86 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.88 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  38.81 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  37.15 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1515  Aldose 1-epimerase  35.54 
 
 		 355 aa  236  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  38.95 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.33 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 347 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  37.16 
 
 		 371 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  37.29 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  37.08 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  37.08 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 361 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  36.8 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  38.11 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.85 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  36.51 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  38.04 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  35.85 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  35.85 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  34.18 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  33.51 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  38.44 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  33.08 
 
 		 438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.22 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  36.96 
 
 		 343 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  34.96 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 351 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  35.92 
 
 		 351 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.43 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  36.96 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  35.85 
 
 		 356 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  34.49 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  35.51 
 
 		 346 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  34.29 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 350 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>