194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2135 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 345 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  41.5 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  42.15 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  42.15 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  43.24 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  41.71 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  40.69 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 355 aa  259  7e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  41.6 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  42.15 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  41.6 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  40.29 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  42.12 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  42.12 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  42.12 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.65 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  42.69 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  42.15 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 387 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  38.78 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  45.08 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  37.78 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  40.47 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  40.87 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  38.44 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  37.74 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  38.32 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  36.63 
 
 		 346 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.29 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  37.14 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 341 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  37.07 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  38.66 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  37.07 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.83 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  34.96 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  37.75 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  36.15 
 
 		 392 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 359 aa  208  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  35.34 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  34.58 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  35.45 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  33.99 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.98 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  34.16 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  37.03 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  37.03 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  37.03 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.42 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.42 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  34.78 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1851  Aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.1 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  34.25 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  35.57 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  32.25 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  37.03 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  32.74 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  34.19 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  34 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  32.26 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  34.99 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 346 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 346 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 350 aa  189  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  32.87 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  33.43 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  31.95 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  31.95 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  31.95 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  31.95 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>