184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1147 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  100 
 
 
368 aa  746    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  55.8 
 
 
375 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  46.95 
 
 
387 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  46.95 
 
 
387 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  47.59 
 
 
384 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  48.03 
 
 
387 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  47.24 
 
 
382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  46.6 
 
 
390 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  47.06 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  45.97 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  45.83 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 
382 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  44.91 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  46.33 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.86 
 
 
383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  45.14 
 
 
387 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  43.01 
 
 
380 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  46.42 
 
 
393 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  44.32 
 
 
414 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  44.75 
 
 
390 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  42.97 
 
 
397 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  46.78 
 
 
346 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  43.82 
 
 
387 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  46.11 
 
 
321 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  46.11 
 
 
346 aa  289  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  46.22 
 
 
346 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 
392 aa  285  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  44.8 
 
 
388 aa  285  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  44.08 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  44.35 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  44.73 
 
 
361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44.99 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  43.79 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 
384 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  42.17 
 
 
392 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  43.34 
 
 
350 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  41.21 
 
 
372 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  40.8 
 
 
434 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  41.57 
 
 
359 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  41.11 
 
 
357 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  41.04 
 
 
355 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.75 
 
 
317 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  41.88 
 
 
359 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 
354 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  41.93 
 
 
355 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 
438 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.29 
 
 
347 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  40.33 
 
 
356 aa  248  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  40.33 
 
 
356 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  39.31 
 
 
406 aa  248  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
362 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
353 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 
357 aa  245  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 
372 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  41.86 
 
 
385 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.67 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  39 
 
 
400 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  38.31 
 
 
360 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  40.86 
 
 
362 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  37.71 
 
 
363 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  40 
 
 
362 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  38.56 
 
 
376 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  40.35 
 
 
377 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
360 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
360 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  36.5 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 
371 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  38.31 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  37.14 
 
 
351 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  35.42 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  37.29 
 
 
361 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  37.91 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 
346 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  34.63 
 
 
339 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  39.26 
 
 
341 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  35.88 
 
 
350 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  33.94 
 
 
343 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
344 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  34.43 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 
343 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
356 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  34.73 
 
 
344 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 
344 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 
356 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 
343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 
343 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  32.96 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  34.15 
 
 
340 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3272  aldose 1-epimerase  34.73 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0965292  hitchhiker  0.000248794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  35.47 
 
 
339 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>