191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2135 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  100 
 
 		 359 aa  733    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  60.29 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  55.52 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  54.47 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  55.71 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 384 aa  335  7.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  49.03 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  49.57 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  47.44 
 
 		 387 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  46.02 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  50.88 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  46.78 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  46.92 
 
 		 390 aa  308  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  46.29 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  46 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  46.63 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 388 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  46.29 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  44.01 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  47.61 
 
 		 384 aa  302  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  46.85 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  47.14 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  48.84 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  47.11 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  42.37 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  45.63 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  45.63 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  45.63 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  46.53 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  43.34 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  42.49 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  45.22 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  42.18 
 
 		 357 aa  280  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  44.86 
 
 		 402 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  44.67 
 
 		 390 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  44.26 
 
 		 414 aa  273  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  45.73 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  45.87 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  41.57 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42.12 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  44.82 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  44.82 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  41.83 
 
 		 355 aa  262  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  46.94 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  43.64 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  39.83 
 
 		 347 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  41.26 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  40.85 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.91 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42.45 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  41.53 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42.45 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  41.53 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  41.81 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  39.39 
 
 		 438 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  39.3 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  35.98 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  37.64 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  39.3 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  39.3 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  39.3 
 
 		 346 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  39.3 
 
 		 346 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  39 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.71 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  39.03 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  38.42 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  36.51 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  43.87 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  39.03 
 
 		 340 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  35.04 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  39.02 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>