218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0630 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  100 
 
 
356 aa  731    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  100 
 
 
356 aa  731    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  59.94 
 
 
347 aa  434  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  53.67 
 
 
356 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  52.84 
 
 
383 aa  349  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 
397 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  51.55 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  50 
 
 
382 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  51.11 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  51.68 
 
 
384 aa  335  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  50.28 
 
 
382 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  51.41 
 
 
387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  51.41 
 
 
387 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  49.58 
 
 
382 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  51.13 
 
 
387 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  51.1 
 
 
380 aa  332  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  51.71 
 
 
388 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  52.47 
 
 
321 aa  322  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  49.86 
 
 
387 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  49.15 
 
 
387 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  48.03 
 
 
397 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  47.91 
 
 
414 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50 
 
 
375 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  48.46 
 
 
393 aa  311  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  49.28 
 
 
390 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  49 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  48.03 
 
 
387 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  47.49 
 
 
357 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  49.44 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  46.97 
 
 
354 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  50.59 
 
 
317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  47.46 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  47.03 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  46.02 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  47.88 
 
 
384 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  46.18 
 
 
346 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  46.18 
 
 
434 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  47.06 
 
 
357 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  45.33 
 
 
346 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  44.38 
 
 
354 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  43.51 
 
 
438 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  45.33 
 
 
346 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  45.03 
 
 
362 aa  289  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.46 
 
 
350 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  44.72 
 
 
402 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  44.93 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  43.39 
 
 
385 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 
400 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  43.82 
 
 
353 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  43.1 
 
 
392 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  45.85 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  43.72 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  42.27 
 
 
355 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  41.85 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  44.82 
 
 
359 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  42.15 
 
 
345 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.7 
 
 
356 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  41.94 
 
 
406 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 
353 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  41.48 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  42.21 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 
377 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  40.33 
 
 
368 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 
363 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  42.21 
 
 
348 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
351 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  41.79 
 
 
338 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  40.11 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 
355 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  39.2 
 
 
340 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  41.9 
 
 
341 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  41.23 
 
 
350 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  42.86 
 
 
357 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 
340 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
352 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  39.94 
 
 
340 aa  235  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  38.35 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 
354 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  39.94 
 
 
362 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  39.36 
 
 
346 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  41.49 
 
 
336 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  39.36 
 
 
346 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  39.36 
 
 
346 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  39.36 
 
 
346 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  39.36 
 
 
346 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  39.36 
 
 
346 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  40.46 
 
 
346 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  39.64 
 
 
340 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 
362 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.55 
 
 
357 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  37.5 
 
 
351 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 
362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 
362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 
413 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.78 
 
 
346 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
356 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 
356 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  39.78 
 
 
362 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  39.11 
 
 
362 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>