225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1503 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
317 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  53.85 
 
 
346 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  54.73 
 
 
346 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  54.09 
 
 
383 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  50.44 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  52.96 
 
 
346 aa  325  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  55.56 
 
 
388 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  52.07 
 
 
346 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  52.06 
 
 
354 aa  321  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  49.71 
 
 
393 aa  316  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  50.15 
 
 
380 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  52.02 
 
 
357 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  50.15 
 
 
397 aa  311  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50.85 
 
 
414 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  50.28 
 
 
372 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  51.3 
 
 
384 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  50.59 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  50.59 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  47.08 
 
 
375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  53.29 
 
 
341 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  48.99 
 
 
387 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  50.29 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  46.49 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 
397 aa  301  8.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  48.81 
 
 
434 aa  301  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  48.55 
 
 
387 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  48.55 
 
 
387 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  47.8 
 
 
355 aa  300  3e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  47.13 
 
 
382 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  47.69 
 
 
382 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  46.76 
 
 
390 aa  297  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.13 
 
 
382 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  52.2 
 
 
321 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 
387 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  50.15 
 
 
355 aa  295  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 
387 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  45.81 
 
 
347 aa  288  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  47.11 
 
 
390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  46.53 
 
 
390 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  48.84 
 
 
372 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  51.3 
 
 
356 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  46.41 
 
 
400 aa  278  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  44.86 
 
 
356 aa  276  4e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.76 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  46.04 
 
 
385 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  43.93 
 
 
384 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  46.8 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  45.66 
 
 
362 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  41.35 
 
 
392 aa  268  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  43.97 
 
 
402 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  44.28 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  46.94 
 
 
359 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  43.75 
 
 
368 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  43.09 
 
 
438 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  42.73 
 
 
354 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  42.94 
 
 
354 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 
359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  45.48 
 
 
346 aa  248  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  44.28 
 
 
363 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  42.17 
 
 
360 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  43.4 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  44.74 
 
 
353 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44.44 
 
 
357 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  44.67 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  43.53 
 
 
351 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  44.48 
 
 
355 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  41.57 
 
 
339 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  45.08 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  39.75 
 
 
319 aa  232  7.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 
340 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  44.54 
 
 
376 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  43.2 
 
 
362 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  41.69 
 
 
350 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  39.8 
 
 
355 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  43.2 
 
 
362 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 
340 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  41.51 
 
 
346 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.24 
 
 
357 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  41.51 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  43.2 
 
 
362 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  38.04 
 
 
406 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  41.51 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  43.2 
 
 
362 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 
360 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  42.12 
 
 
336 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 
360 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  41.51 
 
 
346 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  43.2 
 
 
362 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  41.52 
 
 
338 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
344 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  41.19 
 
 
346 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 
343 aa  222  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  38.44 
 
 
344 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  39.7 
 
 
347 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  38.44 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  38.44 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  40.75 
 
 
356 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  40.75 
 
 
356 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  35.65 
 
 
343 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  38.14 
 
 
344 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>