207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3804 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 340 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  93.82 
 
 		 340 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  68.36 
 
 		 338 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  64.88 
 
 		 353 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  43.92 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  43.67 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  40.87 
 
 		 346 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  39.42 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  40.98 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.75 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  39.13 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  40.91 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  38.42 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.93 
 
 		 397 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  38.68 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  37.36 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  34.48 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 		 382 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  35.51 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  37.95 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  37.82 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.93 
 
 		 382 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 387 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 390 aa  205  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  35.77 
 
 		 380 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  34.67 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  36.78 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  35.38 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 359 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  36.23 
 
 		 400 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.56 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  36.49 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  35.96 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  35.49 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  32.86 
 
 		 354 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  35.82 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  35.16 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  37.27 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  31.87 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 354 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  34.14 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  34.14 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  35.19 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.29 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  33.84 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  36.9 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  35.1 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  36.29 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  32.69 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  36.17 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  35.41 
 
 		 362 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  35.41 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  35.41 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  33.96 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  32.93 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  34.69 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  36.62 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 357 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  33.83 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  36.1 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>