188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2146 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 351 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  77.21 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  70.37 
 
 		 351 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  70.37 
 
 		 351 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  69.8 
 
 		 351 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  41.03 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.12 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.94 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  39.17 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  39.58 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  38.07 
 
 		 392 aa  238  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  37.53 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 		 382 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 354 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  37.09 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  38.21 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 354 aa  228  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  35.52 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  38.2 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  37.16 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  37.98 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  37.01 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  35.67 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  37.99 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  36.53 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 363 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  35.21 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  34.33 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  34.36 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  37.42 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 354 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 361 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  37.64 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 356 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  37.39 
 
 		 356 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  35.1 
 
 		 371 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  35.48 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 355 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  34.65 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  34.2 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  35.26 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  37.01 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  37.01 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.5 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  35.88 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  34.65 
 
 		 362 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  34.95 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  34.65 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  37.05 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  34.35 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  34.35 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  32.84 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.57 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  35.29 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  34.23 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  36.51 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  34.95 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  31.99 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  37.42 
 
 		 336 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2051  Aldose 1-epimerase  35.14 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  31.81 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  32.92 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  31.86 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  34.83 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  33.92 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  33.13 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>