186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3254 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3254  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 327 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0554047 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3572  putative aldose 1-epimerase protein  96.94 
 
 		 327 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3150  hypothetical protein  78.9 
 
 		 327 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2683  aldose 1-epimerase  46.04 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.33869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  38.97 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2717  aldose 1-epimerase  39.08 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.717761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2751  aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  39.7 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4133  Aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  39.17 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  38.58 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  38.28 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  38.73 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  36.36 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 346 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  37.05 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  37.29 
 
 		 359 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  38.42 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  39.5 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  36.86 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  35.24 
 
 		 383 aa  168  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 434 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  32.73 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  35.04 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  33.81 
 
 		 382 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  39.28 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1309  Aldose 1-epimerase  36.02 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0694346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  32.37 
 
 		 397 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  34 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  31.52 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  34.08 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  36.13 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  34.51 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  31.59 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  35.43 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  32.27 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.26 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.26 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  33.82 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  33.82 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  32.46 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  29.77 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  33.81 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  32.49 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 402 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  35.17 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  32.67 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  32.14 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  31.18 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  29.6 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  31.47 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  31.47 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  30.84 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  31.7 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  34.04 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  28.53 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  33.05 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  32.88 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  32.41 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  32.26 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  32.87 
 
 		 387 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  30.86 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  30.56 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  32.62 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  32.94 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  33.04 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  33.88 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  31.86 
 
 		 371 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  29.79 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>