185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2060 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 351 aa  727    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  77.21 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  70.66 
 
 		 351 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  70.66 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  70.37 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  38.4 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  41.19 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  39.11 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  38.05 
 
 		 359 aa  241  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.53 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  38.86 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  40.64 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  38.59 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  35.37 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  36.87 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  35.8 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3655  aldose 1-epimerase  35.63 
 
 		 413 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  37.16 
 
 		 354 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  34.77 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  36.75 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  38.71 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  39.49 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  35.37 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  40.28 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  35.61 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  36.07 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  33.85 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  35.92 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  35.91 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  38.71 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  36.28 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  34.12 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  36.23 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  36.57 
 
 		 397 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  35 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  36.18 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  35.61 
 
 		 376 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  33.63 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  35.01 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  36.09 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  34.94 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  34.62 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  34.42 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  34.42 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  34.91 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  35.26 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  35.08 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  32.95 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  35.38 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  35.83 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  33.43 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  31.67 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  31.87 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  35.01 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  32.76 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  35.53 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  38.1 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  34.03 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  33.73 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  32.96 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>