197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0489 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 393 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  53.45 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  51.88 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  52.21 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  54.59 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  53.56 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  49.11 
 
 		 392 aa  381  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  50.76 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  53.82 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  52.29 
 
 		 382 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  51 
 
 		 382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  46.48 
 
 		 355 aa  362  8e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 382 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  46.95 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  51.47 
 
 		 355 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  50.56 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  49.3 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  47.75 
 
 		 356 aa  342  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  49.57 
 
 		 354 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  45.67 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  47.43 
 
 		 354 aa  329  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  49.69 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  49.56 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  45.91 
 
 		 346 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  45.76 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  46.61 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  47.98 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  47.01 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  44.15 
 
 		 346 aa  319  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  44.63 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  44.63 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  48.98 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  43.8 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 317 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  43.73 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  41.96 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  41.96 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  44.35 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  46.91 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  48.46 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  48.46 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  40.95 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  44.29 
 
 		 362 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  47.28 
 
 		 361 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  44.01 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  44.57 
 
 		 438 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  40.73 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  46.42 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  40.59 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  41.81 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  41.46 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  43.66 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  44.65 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  41.73 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  43.7 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  40.76 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.29 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  39.5 
 
 		 362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  39.34 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  43.24 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  38.8 
 
 		 371 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  41.35 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.8 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  39.12 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  38.64 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.84 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  39.35 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  38.17 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.54 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  37.98 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  39.05 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  39.05 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 348 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  38.76 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  38.76 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  38.01 
 
 		 340 aa  232  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  38.46 
 
 		 346 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 341 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 352 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  37.2 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  37.65 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  35.89 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>