187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1115 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  100 
 
 
351 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  37.78 
 
 
397 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  37.85 
 
 
383 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  38.04 
 
 
354 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  37.95 
 
 
380 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.1 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
356 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  39.6 
 
 
356 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  36.68 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  36.83 
 
 
392 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  36.54 
 
 
346 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  37.46 
 
 
347 aa  238  9e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  37.64 
 
 
359 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
345 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  34.84 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  35.31 
 
 
355 aa  235  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  36.29 
 
 
434 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  35 
 
 
382 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  34.82 
 
 
361 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  35.73 
 
 
397 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  33.89 
 
 
357 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  34.44 
 
 
382 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  34.57 
 
 
387 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  37.01 
 
 
390 aa  228  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  35.15 
 
 
346 aa  225  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  34.86 
 
 
388 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  34.08 
 
 
382 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  34.71 
 
 
346 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  35.89 
 
 
393 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1851  Aldose 1-epimerase  37.99 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  33.9 
 
 
346 aa  222  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  32.09 
 
 
362 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  34.77 
 
 
355 aa  222  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  34.48 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  35.61 
 
 
384 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  35.38 
 
 
357 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  37.76 
 
 
317 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 
340 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  38.12 
 
 
343 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  34.54 
 
 
360 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  33.9 
 
 
390 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  34.18 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  32.98 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.68 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  36.02 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  34.39 
 
 
356 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  34.39 
 
 
356 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  32.87 
 
 
387 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  34.72 
 
 
438 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  33.93 
 
 
346 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  32.5 
 
 
387 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  32.5 
 
 
387 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  31.64 
 
 
347 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 
359 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  34.96 
 
 
350 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  32.96 
 
 
375 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  32.67 
 
 
402 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  36.5 
 
 
355 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  31.4 
 
 
414 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 
348 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  33.24 
 
 
400 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 
341 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  33.24 
 
 
347 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  32.78 
 
 
357 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  32.48 
 
 
372 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  34.01 
 
 
352 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  32.66 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  32.08 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 
346 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  32.96 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  31.91 
 
 
353 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  34.02 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
350 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  30.64 
 
 
346 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
346 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
346 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
346 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
346 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
346 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  32.01 
 
 
377 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  35.07 
 
 
347 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  30.59 
 
 
355 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  30.52 
 
 
350 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  30.84 
 
 
385 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  33.91 
 
 
354 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 
356 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  34.09 
 
 
362 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  34.09 
 
 
362 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  32.67 
 
 
362 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  30.06 
 
 
350 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  33.52 
 
 
362 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  31.84 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  31.34 
 
 
376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  33.23 
 
 
336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>