194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1264 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  95.98 
 
 		 348 aa  703    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 348 aa  726    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1170  aldose 1-epimerase  69.88 
 
 		 350 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2889  aldose 1-epimerase  71.26 
 
 		 356 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  70.14 
 
 		 347 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  68.51 
 
 		 356 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  68.51 
 
 		 356 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  60.98 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  61.27 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  59.94 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  61.27 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  61.27 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  61.27 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  58.05 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  58.05 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  58.05 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  58.05 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  58.05 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  58.05 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  57.76 
 
 		 346 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  52.49 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  50.88 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0236  aldose 1-epimerase  51.61 
 
 		 347 aa  345  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  46.61 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  46.73 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  45.11 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3331  aldose 1-epimerase  42.38 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  41.23 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  41.1 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 434 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00698  hypothetical protein  55.34 
 
 		 205 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  41.1 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  37.61 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  39.88 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  41.28 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  39.22 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  39.47 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  38.94 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  39.36 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 397 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  38.53 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  39.3 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  39.48 
 
 		 384 aa  225  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  38.29 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  39.18 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  37.1 
 
 		 384 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  39.48 
 
 		 350 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  36.15 
 
 		 387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  36.31 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  36.89 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  37.5 
 
 		 393 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 		 392 aa  218  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  40.95 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  38.07 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  36.44 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  41.38 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  38.3 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  39.05 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  40.74 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  34.3 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  36.54 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  36.93 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  39.81 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  34.81 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  38.29 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  34.51 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  36.73 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  39.2 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  35.84 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  36.47 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  37.11 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  32.37 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  36.99 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0656  Aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  37.1 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0633  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  37.85 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  40.4 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  34.8 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  38.35 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  36.72 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  35.86 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  35.19 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>