206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0621 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 388 aa  776    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  68.78 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  53.66 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  49.61 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  49.87 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  51.6 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  54.6 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  53.95 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  48.66 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  50.52 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  51.31 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  52.15 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  50.65 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  48.06 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  50.39 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  50.39 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  52.87 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  52.3 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  52 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  46.72 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  50.86 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  56.07 
 
 		 321 aa  342  5.999999999999999e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  49.62 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  54 
 
 		 361 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  52.17 
 
 		 387 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  50.55 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  51.08 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  50 
 
 		 346 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  52.01 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  49.2 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  51.59 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  49.56 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  49.57 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  51.57 
 
 		 356 aa  326  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  51.57 
 
 		 356 aa  326  5e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  45.94 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  55.85 
 
 		 317 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  47.03 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  52.27 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  48.84 
 
 		 400 aa  318  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  45.38 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  45.38 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  47.83 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  45.22 
 
 		 354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  52.84 
 
 		 350 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  49.58 
 
 		 359 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  47.03 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  50.72 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  47.11 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  47.54 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  43.67 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  44.21 
 
 		 355 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  49.02 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  42.86 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  46.09 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.81 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  45.79 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  44.61 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  43.06 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 362 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  44.73 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  43.2 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  45.74 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  43.71 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  42.9 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  43.43 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  43.47 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  37.24 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  41.43 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  40.9 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  40.34 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  35.22 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  39.14 
 
 		 355 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3669  aldose 1-epimerase  38.55 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  42.45 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  40.49 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  36.06 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  40.88 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  40.86 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  40.86 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  35.96 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  40.57 
 
 		 351 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  39.51 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  40.31 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.86 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  40.44 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  43.08 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>