211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4631 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 361 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  72.86 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  56.82 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  55.94 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  53.37 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  55.71 
 
 		 359 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 387 aa  345  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  52.79 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50.27 
 
 		 414 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  54 
 
 		 388 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  54.13 
 
 		 346 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50.56 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  49.14 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  51.59 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  49.28 
 
 		 354 aa  328  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  49.14 
 
 		 380 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  48.17 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  47.89 
 
 		 382 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  52.56 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  48.87 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 346 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  55.25 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 387 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  49 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  49 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  49.71 
 
 		 346 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  45.22 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  48.43 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  50.42 
 
 		 357 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  48.86 
 
 		 351 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  50.43 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  44.94 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  49.29 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  43.27 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  49.44 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  49.44 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  47.28 
 
 		 393 aa  305  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  50.29 
 
 		 317 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  47.14 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  46.89 
 
 		 357 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  46.86 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  47.38 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  48.37 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  44.76 
 
 		 347 aa  291  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  43.68 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  46.72 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  45.76 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  44.73 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  44.83 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  43.1 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  46.24 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  42.65 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  47.23 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  43.13 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  41.34 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  44.92 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  41.33 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  38.57 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  37.57 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  39.65 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  43.79 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  42.61 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  42.94 
 
 		 339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  43.14 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3031  aldose 1-epimerase  42.2 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  41.79 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  34.82 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  39.61 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  42.24 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  38.79 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  42.29 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  42.07 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  36.34 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  37.28 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  38.3 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  41.46 
 
 		 362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  40.86 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  35.5 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.25 
 
 		 348 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  38.78 
 
 		 350 aa  222  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  41.21 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.37 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  39.72 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0451  aldose 1-epimerase  42.64 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0577  Aldose 1-epimerase  35.76 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0660  aldose 1-epimerase  37.13 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  36.84 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>